Bugüne kadar çeşitli organizmalardan 200'den fazla antimikrobiyal peptit izole edilmiştir ve bunların 170'inden fazlası yalnızca böceklerden türetilmiştir. Bu peptitler kökenlerine ve yapısal özelliklerine göre sınıflandırılır.
Helisel yapıya sahip doğrusal peptitler
Cecropinler keşfedilen ilk hayvan antimikrobiyal peptitleriydi; Boman ve arkadaşları tarafından Amerikan ipekböceğinin (*Hyalophora cecropia*) pupalarından izole edilmiştir. 1980'de.
Spesifik amino asitler açısından zengin doğrusal peptidler
Apidaecinler, bal arılarından izole edilen prolin{0}zengin peptit antibiyotiklerdir. Tipik olarak 16-18 amino asit kalıntısından oluşurlar; prolin içeriği %33'e, arginin içeriği ise %17'ye ulaşır. Apidaecinler belirli Gram-negatif bakterilere karşı güçlü aktivite sergiler ancak Gram-pozitif bakterilere karşı etkisizdir.
Tek bir disülfit bağı içeren peptidler
Bu, antimikrobiyal peptitlerin küçük bir sınıfıdır. Keşfedilen bu türden ilk peptid, sığır nötrofillerinden türetilen baktenesindir. 12 amino asit içerir-dört arginin kalıntısı dahil- ve ikinci ve onbirinci kalıntılar arasında bir disülfür bağı oluşturur.
İki veya daha fazla disülfit bağı içeren peptitler
Defensinler bu sınıfın prototip temsilcileridir. Başlangıçta keşfedilen ve memeli dokularından elde edilen -defensinler genellikle 29-34 amino asit kalıntısı içerir; altı korunmuş sistein kalıntısı üç molekül içi disülfür bağı oluşturur. Ek olarak, 6 ve 15. konumlardaki arginin kalıntılarının yanı sıra 24. konumdaki bir glisin kalıntısı da korunur.
Lantibiyotikler
Lantibiyotikler bakteriler tarafından üretilen peptit antibiyotiklerdir; genetik olarak kodlanırlar, ribozomlarda sentezlenirler ve belirli organik grupları dahil etmek için-translasyon sonrası değişikliğe uğrarlar. Nisin bunlar arasında en kapsamlı şekilde incelenenidir.
